Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM87AQ8NBN3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM87AQ8NBN3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms