Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COLGALT1Q8NBJ5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COLGALT1Q8NBJ5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms