Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC33Q8N5R6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC33Q8N5R6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms