Protein–RNA interactions for Protein: Q8N309

LRRC43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC43Q8N309 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRC43Q8N309 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC43Q8N309 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC43Q8N309 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC43Q8N309 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC43Q8N309 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC43Q8N309 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC43Q8N309 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC43Q8N309 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC43Q8N309 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC43Q8N309 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC43Q8N309 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC43Q8N309 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC43Q8N309 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC43Q8N309 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms