Protein–RNA interactions for Protein: Q8N140

EID3, EP300-interacting inhibitor of differentiation 3, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EID3Q8N140 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EID3Q8N140 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EID3Q8N140 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms