Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z9

VSIG10, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10Q8N0Z9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
VSIG10Q8N0Z9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VSIG10Q8N0Z9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms