Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RPAP2Q8IXW5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPAP2Q8IXW5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms