Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV76

PASD1, Circadian clock protein PASD1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PASD1Q8IV76 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PASD1Q8IV76 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms