Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX29P2Q8IUI4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNX29P2Q8IUI4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms