Protein–RNA interactions for Protein: Q86WI3

NLRC5, Protein NLRC5, humanhuman

Predictions only

Length 1,866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC5Q86WI3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NLRC5Q86WI3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRC5Q86WI3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRC5Q86WI3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRC5Q86WI3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRC5Q86WI3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRC5Q86WI3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRC5Q86WI3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRC5Q86WI3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRC5Q86WI3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRC5Q86WI3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRC5Q86WI3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRC5Q86WI3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRC5Q86WI3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRC5Q86WI3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRC5Q86WI3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRC5Q86WI3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRC5Q86WI3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRC5Q86WI3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRC5Q86WI3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRC5Q86WI3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRC5Q86WI3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRC5Q86WI3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRC5Q86WI3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRC5Q86WI3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRC5Q86WI3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRC5Q86WI3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRC5Q86WI3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRC5Q86WI3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRC5Q86WI3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRC5Q86WI3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRC5Q86WI3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRC5Q86WI3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRC5Q86WI3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRC5Q86WI3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms