Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z460

CLASP1, CLIP-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASP1Q7Z460 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CLASP1Q7Z460 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CLASP1Q7Z460 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms