Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B1

NEGR1, Neuronal growth regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEGR1Q7Z3B1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEGR1Q7Z3B1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NEGR1Q7Z3B1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEGR1Q7Z3B1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEGR1Q7Z3B1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEGR1Q7Z3B1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEGR1Q7Z3B1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEGR1Q7Z3B1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEGR1Q7Z3B1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEGR1Q7Z3B1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEGR1Q7Z3B1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEGR1Q7Z3B1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEGR1Q7Z3B1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEGR1Q7Z3B1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEGR1Q7Z3B1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEGR1Q7Z3B1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEGR1Q7Z3B1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEGR1Q7Z3B1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEGR1Q7Z3B1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEGR1Q7Z3B1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NEGR1Q7Z3B1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEGR1Q7Z3B1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEGR1Q7Z3B1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEGR1Q7Z3B1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEGR1Q7Z3B1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEGR1Q7Z3B1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEGR1Q7Z3B1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEGR1Q7Z3B1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEGR1Q7Z3B1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEGR1Q7Z3B1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEGR1Q7Z3B1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEGR1Q7Z3B1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEGR1Q7Z3B1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEGR1Q7Z3B1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEGR1Q7Z3B1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEGR1Q7Z3B1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEGR1Q7Z3B1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEGR1Q7Z3B1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEGR1Q7Z3B1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEGR1Q7Z3B1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEGR1Q7Z3B1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms