Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
MED13LQ71F56 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED13LQ71F56 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED13LQ71F56 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED13LQ71F56 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED13LQ71F56 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED13LQ71F56 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED13LQ71F56 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MED13LQ71F56 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED13LQ71F56 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED13LQ71F56 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED13LQ71F56 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED13LQ71F56 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED13LQ71F56 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MED13LQ71F56 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED13LQ71F56 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED13LQ71F56 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED13LQ71F56 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED13LQ71F56 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED13LQ71F56 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED13LQ71F56 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED13LQ71F56 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED13LQ71F56 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED13LQ71F56 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED13LQ71F56 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED13LQ71F56 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED13LQ71F56 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED13LQ71F56 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED13LQ71F56 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED13LQ71F56 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MED13LQ71F56 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED13LQ71F56 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MED13LQ71F56 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED13LQ71F56 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED13LQ71F56 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED13LQ71F56 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MED13LQ71F56 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MED13LQ71F56 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MED13LQ71F56 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MED13LQ71F56 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MED13LQ71F56 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MED13LQ71F56 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MED13LQ71F56 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MED13LQ71F56 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms