Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
FGD6Q6ZV73 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FGD6Q6ZV73 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
FGD6Q6ZV73 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
FGD6Q6ZV73 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
FGD6Q6ZV73 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
FGD6Q6ZV73 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
FGD6Q6ZV73 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
FGD6Q6ZV73 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FGD6Q6ZV73 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FGD6Q6ZV73 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FGD6Q6ZV73 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FGD6Q6ZV73 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FGD6Q6ZV73 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FGD6Q6ZV73 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FGD6Q6ZV73 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
FGD6Q6ZV73 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FGD6Q6ZV73 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
FGD6Q6ZV73 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FGD6Q6ZV73 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FGD6Q6ZV73 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
FGD6Q6ZV73 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
FGD6Q6ZV73 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
FGD6Q6ZV73 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
FGD6Q6ZV73 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
FGD6Q6ZV73 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
FGD6Q6ZV73 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
FGD6Q6ZV73 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
FGD6Q6ZV73 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
FGD6Q6ZV73 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
FGD6Q6ZV73 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
FGD6Q6ZV73 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
FGD6Q6ZV73 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
FGD6Q6ZV73 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
FGD6Q6ZV73 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
FGD6Q6ZV73 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
FGD6Q6ZV73 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
FGD6Q6ZV73 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms