Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC149Q6ZUS6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC149Q6ZUS6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms