Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms