Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCNI2Q6ZMN8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNI2Q6ZMN8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNI2Q6ZMN8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNI2Q6ZMN8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNI2Q6ZMN8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNI2Q6ZMN8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNI2Q6ZMN8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNI2Q6ZMN8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNI2Q6ZMN8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms