Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSMFQ6X4W1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NSMFQ6X4W1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms