Protein–RNA interactions for Protein: Q6W349

LINC00575, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00575, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00575Q6W349 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LINC00575Q6W349 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms