Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINGO4Q6UY18 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINGO4Q6UY18 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms