Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LRIG3Q6UXM1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG3Q6UXM1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms