Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCIMPQ6UWF3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms