Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRSAM1Q6UWE0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRSAM1Q6UWE0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms