Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDC42EP5Q6NZY7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CDC42EP5Q6NZY7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms