Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LRRC8EQ6NSJ5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LRRC8EQ6NSJ5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms