Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDF6Q6KF10 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF6Q6KF10 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms