Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
KRT80Q6KB66 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KRT80Q6KB66 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms