Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPECC1LQ69YQ0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms