Protein–RNA interactions for Protein: Q68G75

LEMD1, LEM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD1Q68G75 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LEMD1Q68G75 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms