Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATAD3CQ5T2N8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATAD3CQ5T2N8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms