Protein–RNA interactions for Protein: Q5T124

UBXN11, UBX domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN11Q5T124 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UBXN11Q5T124 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBXN11Q5T124 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms