Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQI0

ATAT1, Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAT1Q5SQI0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATAT1Q5SQI0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATAT1Q5SQI0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms