Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRMS1LQ5PSV4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRMS1LQ5PSV4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms