Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNT1Q5JUK3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNT1Q5JUK3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms