Protein–RNA interactions for Protein: Q5JU00

TCTE1, T-complex-associated testis-expressed protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTE1Q5JU00 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TCTE1Q5JU00 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCTE1Q5JU00 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms