Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HERC4Q5GLZ8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERC4Q5GLZ8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms