Protein–RNA interactions for Protein: Q5C9Z4

NOM1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1Q5C9Z4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOM1Q5C9Z4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NOM1Q5C9Z4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NOM1Q5C9Z4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOM1Q5C9Z4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOM1Q5C9Z4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOM1Q5C9Z4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOM1Q5C9Z4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOM1Q5C9Z4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOM1Q5C9Z4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOM1Q5C9Z4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOM1Q5C9Z4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOM1Q5C9Z4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOM1Q5C9Z4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOM1Q5C9Z4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOM1Q5C9Z4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NOM1Q5C9Z4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NOM1Q5C9Z4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOM1Q5C9Z4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOM1Q5C9Z4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOM1Q5C9Z4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NOM1Q5C9Z4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOM1Q5C9Z4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOM1Q5C9Z4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOM1Q5C9Z4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOM1Q5C9Z4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOM1Q5C9Z4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOM1Q5C9Z4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOM1Q5C9Z4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOM1Q5C9Z4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOM1Q5C9Z4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOM1Q5C9Z4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NOM1Q5C9Z4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOM1Q5C9Z4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOM1Q5C9Z4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOM1Q5C9Z4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOM1Q5C9Z4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOM1Q5C9Z4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOM1Q5C9Z4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOM1Q5C9Z4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms