Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRDTQ58F21 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRDTQ58F21 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BRDTQ58F21 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRDTQ58F21 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRDTQ58F21 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRDTQ58F21 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRDTQ58F21 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRDTQ58F21 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BRDTQ58F21 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRDTQ58F21 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRDTQ58F21 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BRDTQ58F21 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BRDTQ58F21 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRDTQ58F21 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRDTQ58F21 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRDTQ58F21 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRDTQ58F21 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms