Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KHDC3LQ587J8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms