Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFT2D3Q587I9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFT2D3Q587I9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms