Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB6CQ53S08 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms