Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFTN2Q52LD8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RFTN2Q52LD8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RFTN2Q52LD8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms