Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC39A12Q504Y0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC39A12Q504Y0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms