Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTXN3Q4LDR2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTXN3Q4LDR2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 894.9 ms