Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SVEP1Q4LDE5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVEP1Q4LDE5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms