Protein–RNA interactions for Protein: Q4JDL3

PTPN20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN20Q4JDL3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPN20Q4JDL3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN20Q4JDL3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms