Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TSR1Q2NL82 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSR1Q2NL82 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms