Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KNOP1Q1ED39 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
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