Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PFKFB3Q16875 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PFKFB3Q16875 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PFKFB3Q16875 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PFKFB3Q16875 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PFKFB3Q16875 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PFKFB3Q16875 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PFKFB3Q16875 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PFKFB3Q16875 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PFKFB3Q16875 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PFKFB3Q16875 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PFKFB3Q16875 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PFKFB3Q16875 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PFKFB3Q16875 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PFKFB3Q16875 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PFKFB3Q16875 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PFKFB3Q16875 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PFKFB3Q16875 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PFKFB3Q16875 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PFKFB3Q16875 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PFKFB3Q16875 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PFKFB3Q16875 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PFKFB3Q16875 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PFKFB3Q16875 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PFKFB3Q16875 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PFKFB3Q16875 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PFKFB3Q16875 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PFKFB3Q16875 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PFKFB3Q16875 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PFKFB3Q16875 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PFKFB3Q16875 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PFKFB3Q16875 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PFKFB3Q16875 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PFKFB3Q16875 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PFKFB3Q16875 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms