Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SGCBQ16585 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCBQ16585 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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